Hallo Pinsel,
da stimme ich erst mal Rahel zu!
Du müsstest Dir erst mal überlegen, was genau Du da überhaupt testest (sorry für die Wiederholung). Du sagst, Du vergleichst unterschiedliche Krankheitsverläufe, scheinbar in Abhängigkeit zu bestimmten Variablen?Was möchtest Du dann testen? Zusammenhänge? Unterschiede? Wie sind die Daten skaliert? Davon hängt schon mal ziemlich ab, welche Tests in Frage kommen. Es gibt da so einen hübschen Entscheidungsbaum:
http://www.vislab.ch/Lehre/EST/Entscheidungsbaum_SPSS.pdf - der kann schon mal für den Einstieg helfen.
Ich würde mir außerdem ein paar vernünftige Bücher dazu besorgen (z.B. Bortz/Döring oder Brosius: SPSS, mein absoluter Erklärungs-Favorit) und dann für jeden bei Deinen Fragestellungen möglichen Test nachsehen, ob der auch für geringe Fallzahlen geeignet ist.
Viel Erfolg!
Mathilda